¿Qué significa eclipse-apilado en química?

Significa acumulación superpuesta completa. Por ejemplo, la conformación del etano se eclipsa cuando los tres enlaces carbono-hidrógeno de dos átomos de carbono se superponen completamente cuando se ve desde un lado. Y apilado significa que lo que se menciona aquí no es necesariamente la conformación de un determinado compuesto, sino que probablemente se refiere a la disposición y apilamiento de las moléculas. No diste el contexto, por lo que es difícil ayudarte a juzgar, pero si das el contexto, puedo ayudarte a confirmarlo de inmediato.