¿Qué es la bolita negra en la animación japonesa?

En "Mi vecino Totoro" se llama Chen-kun, y en "El viaje de Chihiro" se llama Qiuqiu-kun

La diferencia es que traducido es lo mismo, en japonés se se llama ススヮタリ.

Debería ser algún tipo de elfo o algo así.

No hacen daño. Antes de que te des cuenta, se habrán ido.

Los japoneses solían ser panteístas e imaginaban algunas de las cosas que experimentaban en la vida (como el hollín al limpiar) como dioses.