Vegetación densa en las montañas Rwenzori.
El punto más alto de la sierra es el monte Margarita. Al caminar por la montaña, el entorno ecológico cambia mucho y el pie de la montaña está cubierto de densos pastizales. La pradera se extiende por unos 1200-1500 metros, dando paso aquí a bosques altos. Las especies de árboles dominantes aquí son el cedro, el alcanfor y el podocarpus, que pueden crecer hasta 49 metros. La altura dominante de la selva tropical alcanza los 2400 metros, donde la selva tropical desaparece en el bosque de bambú. El bosque de bambú crece tan denso que ni los animales salvajes ni la luz del sol pueden penetrar en él. El bambú puede crecer hasta 15 metros de altura. Por encima de los 3.000 metros se encuentra la zona pantanosa subalpina, dominada por carex y pastizales agrestes, así como por escasos bosques compuestos de enebros y podocarpus. Las ramas retorcidas y anudadas están salpicadas de musgo, agrimonia, helechos y largas cintas de líquenes, todos los cuales prosperan en la atmósfera húmeda durante todo el año. Esta dramática ilusión le ha valido el sobrenombre de "Montaña de la Luna". Más arriba, a más de 4.270 metros, se encuentra un cinturón alpino compuesto de lagos, glaciares, cascadas de hielo y una flora única. Las plantas herbáceas enanas suelen constituir aquí una gran proporción. Las especies de árboles comunes incluyen Senecio, lobelia e Hypericum, todos los cuales pueden crecer hasta 9 metros de altura y tener una corteza tan gruesa como el corcho. El suelo aquí está cubierto de basura espesa. Al final de cada rama hay una roseta de hojas anchas y carnosas cubiertas de finos pelos plateados. Estas hojas en roseta rodean puntos de crecimiento sensibles y cuando las temperaturas caen en picado por la noche, las hojas las envuelven para protegerlas de los daños de las heladas.