¿Cómo se produjo este cómic? ¿Se dibujó a mano o se renderizó en 3D?

Nada que ver con el 3D, pero sí muy bien modelado por la pintura y la luz. El renderizado 3D se basa en un modelo excelente, que es diez veces más difícil que este.

No conozco el software específico. Hay muchos tipos, la mayoría de los cuales probablemente sean PS o SAI. Si la tecnología existe, no importa qué software utilice. Es solo que la gente puede dibujar bien y dibujar directamente a este nivel. Este tipo de refinamiento y luces y sombras no son muy completos, pero la imagen es cómoda y estable, por encima del promedio.